病毒(Viruses s. str.)严格意义上定义为一类编码至少一个作为其病毒粒子主要成分的移动性遗传元件(MGEs)，病毒粒子包装含有其整个MGE序列的核酸，或其他任何源自于此类编码病毒粒子蛋白的MGE祖先的物体，如：长末端重复序列反转录转座子、噬菌体、聚整合转座子(polinton)、卫星病毒和噬病毒体(virophage)，以及某些RNA病毒无衣壳的衍生物，比如葡萄孢病毒科Botourmiaviridae、线粒体病毒科Mitoviridae及裸RNA病毒科Narnaviridae. 任何一个病毒类群都必须是单系类群。