细胞内高浓度2’3’-cGAMP触发、Mn2+促进、STING蛋白相分离形成的立方膜结构被命名为“STING相分离器”（STING Phase-Separator），用于对未激活的STING-TBK1（也包括2’3’-cGAMP）进行分隔，从而在另外一个层次保证天然免疫不会过度活化

2021年2月6日,中国工程院院士、南开大学校长曹雪涛受邀在《免疫学综述年鉴》发表题为《天然免疫与炎症的表观重塑》的综述文章。据悉,《免疫学综述年鉴》是国际权威性免疫学术刊物,一年一集,只发表杂志编委会根据国际免疫学研究进展而特邀著名专家撰写的稿件。

该综述文章长达32页,首次提出了“Epiregulome”(表观元控组)的新概念:即基因启动子、增强子等转录调控区域各种染色体水平的修饰(如DNA甲基化、组蛋白修饰等),及其结合蛋白或非编码RNA组成独立于基因组序列的表观调控元件,构建了区域特异性染色质状态,从而关键性地调控基因特异性表达和细胞特征性功能。

曹雪涛介绍,该综述围绕这一新概念,系统阐述了细胞分化、发育、应激过程中组织器官微环境信号如何通过构建细胞 “表观元控组”,来构建天然免疫细胞特征性功能状态,从而精确调控天然免疫与炎症反应。

表观调控立足于不依赖DNA序列的染色质层面,涉及DNA、组蛋白等共价修饰、非编码RNA及染色质结合蛋白等相关元素的参与和调控。各种表观修饰及其结合分子等元素交叉调控决定了基因组不同区域的染色质状态,在基因特异性表达调控中发挥关键性作用。“因此,表观调控在多种生理、病理过程中决定了细胞特征性功能状态的建立和改变,对健康维持与疾病发展研究极为重要。”曹雪涛表示。

为什么天然免疫细胞是机体抵御病原体入侵的第一道防线?为什么组织器官微环境能使天然免疫细胞分化、发育、进而成熟为可快速识别病原体并迅速启动免疫反应特征功能和能力?病原体感染后,天然免疫细胞如何由活化状态进入消退或耐受状态,甚至重塑为“适应性”天然免疫细胞以更强应对二次感染?近年来,剖析表观遗传因子如何精确调控天然免疫细胞分化与发育、天然免疫起始与消退,以及天然免疫记忆的产生,成为国际免疫学界的前沿热点。

在该综述中,曹雪涛与第二军医大学副教授张迁首先概述了近年来表观遗传调控的新进展,包括5-羟甲基化等DNA甲基化的氧化修饰,m6A等RNA修饰组成的表观转录组,以及染色质高级空间结构等,提出了表观调控领域的热点和难点问题。

随后,综述从4个层面系统阐述了天然免疫的表观调控模式。第一,聚焦关键天然免疫细胞类型,如巨噬细胞、树突状细胞和天然淋巴细胞的分化发育。通过列举该方面的代表性研究成果,文章阐述了组织微环境信号如何通过细胞谱系特异性转录因子和表观调控因子的层级和相互调控,诱导天然免疫细胞特征性分化成熟和极化。

含硒的尿苷，通常是尿苷的2-氧被硒所取代，从含硒的转移核糖核酸中分离得到。

转移核糖核酸中发现的稀有核苷，常位于某些转移核糖核酸中反密码子的3′邻位。

转移核糖核酸中发现的一种稀有核苷。

脂质代谢关键因子CREBZF作为一个转录辅助调节因子（coregulator）通过负调控STAT3的活性，进而抑制肝组织的再生的分子机制。在肝脏受损或者部分切除的情况下，CREBZF-STAT3途径可能是一个重要的细胞内信号，防止肝脏过度再生并维持标准肝脏质量。

分子倒置探针技术是一项新发展起来的用于目标序列捕获的分子生物学技术,该技术通过设计特异的探针对已知的特定目的基因组序列进行捕获,将目标序列DNA富集后再利用芯片杂交或测序进行检测。此技术有助于研究人员对大样本中的基因组重要区域进行研究,避免了全基因组研究费用高、分析困难等问题。并且,分子倒置探针技术弥补了杂交捕获技术、PCR捕获技术等分子捕获手段的不足,为动植物及病原菌重要DN**段的研究提供强有力的技术支持。

靶向富集（target enrichment）是扩增样品中感兴趣的一部分基因，从而提高测序的信噪比。

利用蛋白质组学、染色质免疫沉淀测序、RNA测序等方法，发现了一种新的组蛋白修饰：赖氨酸苯甲酰化（benzoylation），这种修饰影响了一些信号和代谢基因的表达。他们还发现，赖氨酸苯甲酰化修饰可由苯甲酸钠诱导，受到 NAD+依赖性的去乙酰化酶SIRT2调控。

为了能从细胞和组织中提取膜蛋白进行分析，他们设计并筛选了大量化合物，从中找到了一种“可光裂解（photocleavable）”的表面活性剂——Azo。