CAG重复扩增的另一个重要特点——体细胞扩增（somatic expansion）。这一过程指的是CAG重复序列在个体的生命周期中不断扩展，特别是在神经元中，这种扩展表现得尤为明显。通过单细胞技术，研究人员能够追踪每个神经元中的CAG重复序列长度，并发现这些重复在神经元发育过程中不断增加。这一发现挑战了传统的亨廷顿病研究假设，揭示了CAG扩展是一个持续且动态的过程，而不仅仅是一个遗传传递的现象。 在亨廷顿病患者的大脑中，特别是尾状核区域，研究表明几乎所有神经元的CAG重复序列都经历了显著的扩展。初步的CAG扩展通常发生缓慢，但随着神经元老化，CAG扩展的速度急剧加快。这个过程被分为几个阶段：从慢扩展的早期阶段，到快速扩展的中期，再到最终的基因表达紊乱和神经元死亡。