以下为句子列表：
英文: CHARMM is a program for macromolecular dynamics and mechanics.
中文: CHARMM是大分子动力学和力学的程序。
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英文: It can also perform molecular dynamics simulations.
中文: 它能也执行分子的动力学模拟。
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英文: Method A coarse grained molecular dynamics method is adopted to simulate the collapse of the biomolecules with two kinds of sequence composition.
中文: 方法基于粗粒化分子动力学模拟方法，研究均匀分子链和非均匀分子链的自组织坍塌过程。
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英文: NAMD - NAMD is a parallel, object-oriented molecular dynamics program designed for high-performance simulation of large biomolecular systems.
中文: NAMD是一个并行的，面向对象的模块化的动力学程序，设计为高性能地模拟大型生物分子系统。
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英文: The dependence of superlattice thermal conductivity on period length is investigated by nonequilibrium molecular dynamics simulation.
中文: 摘要采用非平衡态分子动力学方法模拟了超晶格的法向导热系数随周期长度的变化关系。
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