University of Texas Southwestern Medical Center at Dallas的分子遗传学教授Masashi Yanagisawa博士及其同事为新研究的蛋白定名为食欲肽（英语：Orexin），以表明它“开胃”/“促进食欲的”的作用。（英语形容词：orexigenic）
另一方面，Luis DeLecea, Thomas Kilduff及其同事亦发表这种蛋白的发现，并命名为下丘脑泌素（英语：hypocretins），以表明其源自下丘脑的合成，并同时反映了肠促胰岛素（英语：incretin）的相似性。
名称仍然在争论中，食欲肽一名被受争议，原因是有证据表明促进食欲的的效果可能只是伴随的或微不足道的。另一方面亦有人认为下丘脑泌素的命名是尴尬的，并指出很多神经肽的名称跟其主要作用也是没有关系。除非在科学界获得共识，否则食欲肽跟下丘脑泌素两个名称似乎将会继续在不同的学界发表中出现。