您现在的位置:生物医药大词典 >> 通用词典 >> 词汇解释: Modularity
Modularity
分享到:
模块度

分类:分子生物学          |    查看相关文献(pubmed)   |    免费全文文献

详细解释:

模块度(Modularity)的概念。以无向网络为例,假设L为网络中所有边的个数。当我们把此网络划分为Nm个模块时,若s 为其中一子模块,而 ls为子模块中边数之和,ds为子模块中点的数之和,则模块度可表示为:sigma(1->Nm)(ls/L)-(ds/2*L)^2(见纸质版)。在确定了模块度的定义后,则鉴定基因模块的算法就是去如何优化模块度的最大值。在针对如何优化模块度的问题时,现有的算法大致采取两种策略:(1)随机算法(这里暂定为模拟退火法)(6,7);(2)贪心法(greedy)(7)。模拟退火法为随机算法的一种,它以物理中的固体退火为原理进行实现。因为算法能够以Metropolis准则接受次优解,所以从根本上避免了走入局部最优解的陷阱(尽管当温度趋于0的时候算法类似局部搜索法)。在此方法中,新解得产生过程为:随机合并两个子模块或者随机分开一个子模块以及随机交换两个不同子模块之中的任意两个点,其中每次降温过程共进行点交换 次,子模块运算次,降温次数视降温系数,初始温度,最优解重复次数而定(一般需要降温几千次)。算法特点为以较小的代价获得较优的解。尽管模拟退火法的结果较为准确,但其非常费时,只能适用于小规模的生物网络。而贪心算法尽管可以在较短时间对大规模生物网络进行分析,但其得到的模块有精确度较低的缺点。




以下为句子列表:
英文: Modularity is the process of dividing an object into smaller pieces so each smaller object of module can be dealt with individually.

中文: 模块化是把一个对象分割成(若干)小部分以便每个更小的模块对象可以单独处理。       更详细...
英文: There are a variety of mechanisms believed to be involved, including genomic modularity -- the ability for animals to reorganize their genome in response to stress or other outside influence, heterozygous fractionation (heterozygous genes in parents can l

中文: 认为涉及很复杂的变化机制-动物重组基因组响应压力或其它外在影响的能力(双亲基因杂交会导致孩子们拥有许多纯合子基因的物种形成),而标准地进化。       更详细...
英文: These observations suggest synergistic selection during network evolution and provide insights into the hierarchical modularity of cellular networks. categories.

中文: 这些发现反映了网络进化中的协同选择。也为我们研究细胞网络等级组织提供了切入口。       更详细...
英文: This is where, for example, having some relatively strict rules of object modularity and information hiding is absolutely fundamental.

中文: 例如,它的基本原则之一就是对对象模块性和隐藏信息要有相应的严格规定。       更详细...
分享到:
编辑词条
赞助商链接
你知道它的英文吗?
你知道中文意思吗?
热门分类


成为编辑 - 词典APP下载 - 关于 - 推荐 - 手机词典 - 隐私 - 版权 -链接 - 联系 - 帮助
©2008-2012 生物医药大词典- 自2008年3月1日开始服务 生物谷www.bioon.com团队研发
沪ICP备14018916号-1