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  • Preliminary clinical application of adjuvant vaccine of anti-idiotypic antibody of anti-human bladder carcinoma
    抗人膀胱癌抗独特型抗体佐剂疫苗的临床初步应用

    Production, Identification, Animal Experiment of Adjuvant Vaccine of Anti-idiotypic Antibody of Anti-human Bladder Carcinoma and Its Preliminary Clinical Application
    抗人膀胱癌抗独特型抗体佐剂疫苗的制备、鉴定、动物实验及临床初步应用研究
  • 所谓重叠基因(overlapping gene)是指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列,或是指一段DNA序列成为两个或两个以上基因的组成部分。重叠基因有多种重叠方式。例如,大基因内包含小基因;前后两个基因首尾重叠一个或两个核苷酸;几个基因的重叠,几个基因有一段核苷酸序列重叠在一起,等等。重叠基因中不仅有编码序列也有调控序列,说明基因的重叠不仅是为了节约碱基,能经济和有效地利用DNA遗传信息量,更重要的可能是参与对基因的调控。
  • Colonocyte differentiation is associated with increased expression and altered distribution of protein kinase C isozymes.
  • 模块度(Modularity)的概念。以无向网络为例,假设L为网络中所有边的个数。当我们把此网络划分为Nm个模块时,若s 为其中一子模块,而 ls为子模块中边数之和,ds为子模块中点的数之和,则模块度可表示为:sigma(1->Nm)(ls/L)-(ds/2*L)^2(见纸质版)。在确定了模块度的定义后,则鉴定基因模块的算法就是去如何优化模块度的最大值。在针对如何优化模块度的问题时,现有的算法大致采取两种策略:(1)随机算法(这里暂定为模拟退火法)(6,7);(2)贪心法(greedy)(7)。模拟退火法为随机算法的一种,它以物理中的固体退火为原理进行实现。因为算法能够以Metropolis准则接受次优解,所以从根本上避免了走入局部最优解的陷阱(尽管当温度趋于0的时候算法类似局部搜索法)。在此方法中,新解得产生过程为:随机合并两个子模块或者随机分开一个子模块以及随机交换两个不同子模块之中的任意两个点,其中每次降温过程共进行点交换 次,子模块运算次,降温次数视降温系数,初始温度,最优解重复次数而定(一般需要降温几千次)。算法特点为以较小的代价获得较优的解。尽管模拟退火法的结果较为准确,但其非常费时,只能适用于小规模的生物网络。而贪心算法尽管可以在较短时间对大规模生物网络进行分析,但其得到的模块有精确度较低的缺点。
  • 缩略语:NMDAR
  • 如en、wg被成对基因激活,分别在每个体节的前、后部细胞中表达,以形成和维持体节结构。参见:segmentation gene,pair-rule gene,gap gene
  • 缩略语:EBI
  • 基因沉寂
    基因沉寂(Gene Silencing) 也可以被称为“基因沉默”。基因沉寂是真核生物细胞基因表达调节的一种重要手段。在染色体水平,基因沉寂实际上是形成以染色质(Heterochromatin)的过程,被沉寂的基因区段呈高浓缩状态。基因沉寂需要经历不同的反应过程才能实现,包括组蛋白N端结构域的赖氨酸残基的去乙酰基化加工、甲基化修饰(由甲基转移酶催化,修饰可以是一价、二价和三价甲基化修饰,后者又被称为'过度’甲基化修饰(Hypermethylation) ) 、以及和甲基化修饰的组蛋白结合的蛋白质(MBP)形成“异染色质”,在上述过程中,除了部分组蛋白的N端尾部结构域需要去乙酰化、甲基化修饰之外,有时也许要在其他的组蛋白N端尾部结构域的赖氨酸或精氨酸残基上相应地进行乙酰化修饰,尽管各种修饰的最终结果会导致相应区段的基因“沉寂”失去转录活性。这个'原则’就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化修饰的组蛋白结合"沉寂”相应的染色质为异染色质。此外,基因沉寂也和DNA的甲基化修饰有关,比如在真核生物基因组中的许多基因的5‘端分布有长约1KB( 千碱基对)的“CpG"岛序列(CpG island),其中的“C"芳香环5位可被甲基化修饰,之后,与甲基化修饰的DNA结合蛋白形成“沉寂"区段,使其下游基因不能表达;另外,非编码的RNA分子(non-coding RNA)也参与“基因沉默”过程。这一类型常见于含有重复DNA序列的染色质区,如着丝粒部位的基因沉寂就需要非编码RNA分子的参与。简言之,基因沉寂或者基因沉默是涉及组蛋白甲基化、去乙酰化、乙酰化,DNA的甲基化修饰,甲基化修饰组蛋白结合蛋白Sir2/3/4,甲基化DNA结合蛋白,非编码RNA等等在内的一系列复杂组分的生理反应过程。基因沉寂导致相应区段内的遗传信息不能被转录。
  • 日前发表在《美国国家科学院学报》的一篇新研究报告指出,藉由修改DNA转译成蛋白质的过程,研究人员已经能够停止某些遗传疾病的发生,例如脊髓肌肉萎缩症。主持该研究的伦敦帝国学院FrancescoMuntoni教授表示:“许多基因疾病只是由于人体基因组内30亿个碱基对中的一两个出错而造成。我们发明的这项技术能够让我们修正因基因突变造成的错误剪接,而它就是脊髓肌肉萎缩症的发生原因。”
      借着这项技术,伦敦帝国学院和列斯特大学的研究人员已经能够使用短的、正确的RNA插入到表现子(exon)之中,重新改变剪接的讯号。这个治疗方法已经在脊髓肌肉萎缩症患者的细胞上进行过试验,结果成功的让那些需要剪接的蛋白质制造出来,并使细胞正常发育。列斯特大学的IanEperon博士表示:“我们知道有一些其它的疾病,例如发炎或癌症也有正常基因的剪接改变参与其中,而我们的方法可以允许我们去反转这些错误,并帮助发展出新的治疗方法。”

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